Ένα μυστηριώδες σεντούκι δίνει την ευκαιρία σε μια παρέα τριών παιδιών να ταξιδέψουν στο μακρινό παρελθόν και να ζήσουν την ιστορία του Ναυτίλου και του καπετάν Νέμο,του ανθρώπου που το όνομά του έγινε θρύλος. Κυνηγώντας ένα φοβερό θαλάσσιο τέρας, ο Νέντ, η Μπερναντέτ, και ο καθηγητής Άροναξ βρίσκονται παγιδευμένοι στο Ναυτίλο, κυβερνήτης του οποίου είναι ο Νέμο.
Η ταινία είναι βασισμένη στο κλασικό μυθιστόρημα επιστημονικής φαντασίας του Ιούλιου Βέρν.